Jon travaille dans une usine de Patch Town, où l'on recueille les enfants dans des choux. Avec sa femme Mary, il élève dans le plus grand secret leur fille Daisy, dérobée à l'usine. Par l'entremise d'un collègue, Jon apprend qu'il fut autrefois transformé en poupée selon un procédé de cryogénisation mis sur pied par un savant bienveillant. Hanté par des souvenirs récurrents, l'ouvrier entreprend de retrouver Bethany, la fillette qui l'a abandonné il y a plus d'une vingtaine d'années. Accompagné de Mary et du rusé passeur Sly, il se retrouve bientôt pris en chasse par les sbires de l'infâme Yuri, fils du défunt savant et directeur de l'usine à choux. Peu après, il apprend qu'Avery, la fille préadolescente de Bethany, vient d'être enlevée sur ordre de Yuri, qui souhaite en faire un nouveau modèle de poupée. Jon a bien l'intention de déjouer ce plan, avec la complicité de Bethany.