Yugi est un adolescent captivé par un jeu de stratégie qui se pratique avec des cartes à collectionner. Or, ce passe-temps en apparence innocent recèle un secret fantastique.
En effet, les cartes possèdent un pouvoir mystique très ancien qui peut changer le cours de l'histoire. Dans les profondeurs du désert égyptien, le démon Anubis vient de s'éveiller du long sommeil dans lequel l'avait plongé il y des siècles le Pharaon, un alter ego de Yugi. L'adolescent et ses amis devront maintenant affronter cette créature diabolique qui menace la planète entière.